Флора Серебряного Бора насчитывает около 400 видов сосудистых растений: 324 вида травянистых, 40 — деревьев, 34 — кустарников и два кустарничка. Например, в парке произрастают ива, берёза, дуб, сосна, липа, вяз, орех маньчжурский, лиственница, папоротник, черника, брусника, сирень, барбарис, а также арония, ирга, облепиха, вишня, смородина и другое. В Серебряном Бору можно встретить растения, занесённые в Красную книгу Москвы: борец северный, ветреница лютичная, гудайера ползучая, земляника зелёная, кувшинка снежно-белая, стрелолист обыкновенный, аир обыкновенный, тополь белый, дуб красный, горец земноводный, ландыш майский, дрёма белая, гвоздика Фишера, клевер пашенный и хохлатка плотная и другие.
Фауна насчитывает около 100 видов животных. На территории острова обитают кроты, зайцы, лесной хорёк, обыкновенная бурозубка, полёвки, белки, бобры и выдры. В Красную книгу Москвы занесены ласки, заяц-русак, заяц-беляк, обыкновенный ёж, горностаи, обыкновенные тритоны, и другие виды.